Systeem Biologie 2013: Theoretische Biologie

Home | Rooster | Modellen | Dictaat | Slides | Papers | Tentamen | Links | Docent |

Theoretische Biologie

Voor het modeleren van biologische systemen (systeembiologie) gebruiken we meestal differentiaalvergelijkingen. In dit deel van de cursus leer je hoe je wiskundige modellen kunt lezen, interpreteren, analyseren en op een computer kunt simuleren. We behandelen wiskundige modellen uit een aantal verschillende biologische disciplines zodat je ziet dat de systeembiologie op veel terreinen gebruikt wordt. Aan het eind van de cursus komen ook nog een paar andere modelleringstechnieken aan bod (partiele differentiaal vergelijkinmgen en cellulaire automaten). Al met al vormt dit een brede inleiding in de computationele levenswetenschappen.

Het onderdeel Theoretische Biologie begint op vrijdag 1 maart 2013 en bestaat uit een serie hoorcolleges van 2x45 minuten. Na het hoorcollege word je verwacht de opgaven te maken die in het boek staan. Elk hoofdstuk begint met een "vraag 0" die controleert of je het hoofdstuk gelezen en begrepen hebt. De rest van de vragen is oefenstof die je op het werkcollege en als zelfstudie gaat maken (antwoorden staan achter in het boek). Op het werkcollege kun je hulp vragen bij de opgaven waar je niet uit kwam. De theoretische biologie wordt om en om gegeven met het onderdeel wiskunde (zie het rooster). Zo krijg je precies die wiskunde aangeboden die je voor deze stof nodig hebt.

Het dictaat is vanaf medio februari samen met het wiskunde dictaat voor 10 Euro te koop bij Ton van Domselaar en kan worden ge-download via de knop Dictaat.

Colleges worden opgenomen op video en via deze LectureNet kun je deze terugkijken.

Tijdens de computerpractica gaan we werken met het programma GRIND. De modellen hiervoor kun je downloaden via de knop Modellen.

De regels over het gecombineerde wiskunde en theoretische tentamen staan onder de knop Tentamen. Via die link kun je ook oude tentamens vinden voor oefenstof.

De nieuwe opgave 2.7 kun je hier downloaden.


Home | Rooster | Modellen | Dictaat | Slides | Papers | Tentamen | Links | Docent |


Theoretical Biology & Bioinformatics / Last modified on 20 March 2013 / R.J.DeBoer@uu.nl